Skip to main content
Back to top
Ctrl
+
K
Tutorials
Getting started with anndata
Interfacing pytorch models with anndata
Lazily concatenating multiple AnnData objects
Interfacing pytorch models with collections of AnnData objects
Dask Array Support to AnnData
Awkward Arrays in AnnData
Dask + Zarr, but Remote!
Lazily Accessing Remotely Stored Data
zarr-v3 Guide/Roadmap
API
anndata.AnnData
anndata.AnnData.T
anndata.AnnData.X
anndata.AnnData.filename
anndata.AnnData.is_view
anndata.AnnData.isbacked
anndata.AnnData.layers
anndata.AnnData.n_obs
anndata.AnnData.n_vars
anndata.AnnData.obs
anndata.AnnData.obs_names
anndata.AnnData.obsm
anndata.AnnData.obsp
anndata.AnnData.raw
anndata.AnnData.shape
anndata.AnnData.uns
anndata.AnnData.var
anndata.AnnData.var_names
anndata.AnnData.varm
anndata.AnnData.varp
anndata.AnnData.chunk_X
anndata.AnnData.chunked_X
anndata.AnnData.concatenate
anndata.AnnData.copy
anndata.AnnData.obs_keys
anndata.AnnData.obs_names_make_unique
anndata.AnnData.obs_vector
anndata.AnnData.obsm_keys
anndata.AnnData.rename_categories
anndata.AnnData.strings_to_categoricals
anndata.AnnData.to_df
anndata.AnnData.to_memory
anndata.AnnData.transpose
anndata.AnnData.uns_keys
anndata.AnnData.var_keys
anndata.AnnData.var_names_make_unique
anndata.AnnData.var_vector
anndata.AnnData.varm_keys
anndata.AnnData.write
anndata.AnnData.write_csvs
anndata.AnnData.write_h5ad
anndata.AnnData.write_loom
anndata.AnnData.write_zarr
anndata.concat
anndata.io.read_h5ad
anndata.io.read_zarr
anndata.io.read_elem
anndata.io.sparse_dataset
anndata.io.read_csv
anndata.io.read_excel
anndata.io.read_hdf
anndata.io.read_loom
anndata.io.read_mtx
anndata.io.read_text
anndata.io.read_umi_tools
anndata.AnnData.write_h5ad
anndata.AnnData.write_zarr
anndata.io.write_h5ad
anndata.io.write_zarr
anndata.io.write_elem
anndata.AnnData.write_csvs
anndata.AnnData.write_loom
anndata.experimental.AnnCollection
anndata.experimental.AnnCollection.attrs_keys
anndata.experimental.AnnCollection.convert
anndata.experimental.AnnCollection.has_backed
anndata.experimental.AnnCollection.n_obs
anndata.experimental.AnnCollection.n_vars
anndata.experimental.AnnCollection.obs
anndata.experimental.AnnCollection.obsm
anndata.experimental.AnnCollection.shape
anndata.experimental.AnnCollection.iterate_axis
anndata.experimental.AnnCollection.lazy_attr
anndata.experimental.AnnCollection.to_adata
anndata.experimental.AnnLoader
anndata.experimental.concat_on_disk
anndata.experimental.read_elem_lazy
anndata.experimental.read_lazy
anndata.experimental.read_dispatched
anndata.experimental.write_dispatched
anndata.experimental.IOSpec
anndata.experimental.IOSpec.encoding_type
anndata.experimental.IOSpec.encoding_version
anndata.experimental.Read
anndata.experimental.Write
anndata.experimental.ReadCallback
anndata.experimental.WriteCallback
anndata.experimental.StorageType
anndata.experimental.backed._lazy_arrays.MaskedArray
anndata.experimental.backed._lazy_arrays.MaskedArray.dtype
anndata.experimental.backed._lazy_arrays.MaskedArray.shape
anndata.experimental.backed._lazy_arrays.MaskedArray.base_path_or_zarr_group
anndata.experimental.backed._lazy_arrays.MaskedArray.elem_name
anndata.experimental.backed._lazy_arrays.CategoricalArray
anndata.experimental.backed._lazy_arrays.CategoricalArray.categories
anndata.experimental.backed._lazy_arrays.CategoricalArray.dtype
anndata.experimental.backed._lazy_arrays.CategoricalArray.shape
anndata.experimental.backed._lazy_arrays.CategoricalArray.base_path_or_zarr_group
anndata.experimental.backed._lazy_arrays.CategoricalArray.elem_name
anndata._core.xarray.Dataset2D
anndata._core.xarray.Dataset2D.columns
anndata._core.xarray.Dataset2D.iloc
anndata._core.xarray.Dataset2D.index
anndata._core.xarray.Dataset2D.index_dim
anndata._core.xarray.Dataset2D.is_backed
anndata._core.xarray.Dataset2D.shape
anndata._core.xarray.Dataset2D.true_index
anndata._core.xarray.Dataset2D.true_index_dim
anndata._core.xarray.Dataset2D.true_xr_index
anndata._core.xarray.Dataset2D.xr_index
anndata._core.xarray.Dataset2D.to_memory
anndata.register_anndata_namespace
anndata.types.ExtensionNamespace
anndata.ImplicitModificationWarning
anndata.settings
anndata.settings.override
anndata.abc.CSRDataset
anndata.abc.CSRDataset.format
anndata.abc.CSRDataset.shape
anndata.abc.CSRDataset.dtype
anndata.abc.CSRDataset.backend
anndata.abc.CSRDataset.__getitem__
anndata.abc.CSRDataset.to_memory
anndata.abc.CSCDataset
anndata.abc.CSCDataset.format
anndata.abc.CSCDataset.shape
anndata.abc.CSCDataset.dtype
anndata.abc.CSCDataset.backend
anndata.abc.CSCDataset.__getitem__
anndata.abc.CSCDataset.to_memory
anndata.typing.Index
anndata.typing.AxisStorable
anndata.typing.RWAble
Concatenation
On-disk format
Interoperability
Benchmarks
Simple benchmarks
Contributing
Release notes
References
.rst
.pdf
anndata.AnnData.n_obs
Contents
AnnData.n_obs
anndata.AnnData.n_obs
#
property
AnnData.
n_obs
:
int
[source]
#
Number of observations.
Contents
AnnData.n_obs
