Skip to main content
Ctrl+K
anndata - Home anndata - Home
  • Tutorials
    • Getting started with anndata
    • Interfacing PyTorch models with collections of AnnData objects via annbatch
    • Lazily concatenating multiple AnnData objects
    • Dask Array Support to AnnData
    • Awkward Arrays in AnnData
    • Dask + Zarr, but Remote!
    • Lazily Accessing Remotely Stored Data
    • zarr-v3 Guide/Roadmap
    • Concatenation
  • API
    • anndata.AnnData
      • anndata.AnnData.T
      • anndata.AnnData.X
      • anndata.AnnData.filename
      • anndata.AnnData.is_view
      • anndata.AnnData.isbacked
      • anndata.AnnData.isview
      • anndata.AnnData.layers
      • anndata.AnnData.n_obs
      • anndata.AnnData.n_vars
      • anndata.AnnData.obs
      • anndata.AnnData.obs_names
      • anndata.AnnData.obsm
      • anndata.AnnData.obsp
      • anndata.AnnData.raw
      • anndata.AnnData.shape
      • anndata.AnnData.uns
      • anndata.AnnData.var
      • anndata.AnnData.var_names
      • anndata.AnnData.varm
      • anndata.AnnData.varp
      • anndata.AnnData.chunk_X
      • anndata.AnnData.chunked_X
      • anndata.AnnData.copy
      • anndata.AnnData.obs_keys
      • anndata.AnnData.obs_names_make_unique
      • anndata.AnnData.obs_vector
      • anndata.AnnData.obsm_keys
      • anndata.AnnData.rename_categories
      • anndata.AnnData.strings_to_categoricals
      • anndata.AnnData.to_df
      • anndata.AnnData.to_memory
      • anndata.AnnData.transpose
      • anndata.AnnData.uns_keys
      • anndata.AnnData.unwriteable
      • anndata.AnnData.var_keys
      • anndata.AnnData.var_names_make_unique
      • anndata.AnnData.var_vector
      • anndata.AnnData.varm_keys
      • anndata.AnnData.write
      • anndata.AnnData.write_csvs
      • anndata.AnnData.write_h5ad
      • anndata.AnnData.write_loom
      • anndata.AnnData.write_zarr
    • anndata.acc
      • anndata.acc.AdAcc
      • anndata.acc.AdRef
      • anndata.acc.RefAcc
      • anndata.acc.MapAcc
      • anndata.acc.LayerMapAcc
      • anndata.acc.MultiMapAcc
      • anndata.acc.GraphMapAcc
      • anndata.acc.LayerAcc
      • anndata.acc.MetaAcc
      • anndata.acc.MultiAcc
      • anndata.acc.GraphAcc
      • anndata.acc.Idx2D
      • anndata.acc.NO_IDX
    • anndata.concat
    • anndata.io.read_h5ad
    • anndata.io.read_zarr
    • anndata.io.read_elem
    • anndata.io.sparse_dataset
    • anndata.io.read_csv
    • anndata.io.read_excel
    • anndata.io.read_hdf
    • anndata.io.read_mtx
    • anndata.io.read_text
    • anndata.io.read_umi_tools
    • anndata.AnnData.write_h5ad
    • anndata.AnnData.write_zarr
    • anndata.AnnData.unwriteable
    • anndata.io.read_loom
    • anndata.AnnData.write_loom
    • anndata.io.write_h5ad
    • anndata.io.write_zarr
    • anndata.io.write_elem
    • anndata.AnnData.write_csvs
    • anndata.experimental.AnnCollection
      • anndata.experimental.AnnCollection.attrs_keys
      • anndata.experimental.AnnCollection.convert
      • anndata.experimental.AnnCollection.has_backed
      • anndata.experimental.AnnCollection.n_obs
      • anndata.experimental.AnnCollection.n_vars
      • anndata.experimental.AnnCollection.obs
      • anndata.experimental.AnnCollection.obsm
      • anndata.experimental.AnnCollection.shape
      • anndata.experimental.AnnCollection.lazy_attr
      • anndata.experimental.AnnCollection.to_adata
    • anndata.experimental.AnnLoader
    • anndata.experimental.concat_on_disk
    • anndata.experimental.read_elem_lazy
    • anndata.experimental.read_lazy
    • anndata.experimental.read_dispatched
    • anndata.experimental.write_dispatched
    • anndata.experimental.IOSpec
    • anndata.experimental.Read
    • anndata.experimental.Write
    • anndata.experimental.ReadCallback
    • anndata.experimental.WriteCallback
    • anndata.experimental.backed.MaskedArray
    • anndata.experimental.backed.CategoricalArray
    • anndata.experimental.backed.Dataset2D
    • anndata.experimental.Dataset2DIlocIndexer
    • anndata.experimental.StorageType
    • anndata.register_anndata_namespace
    • anndata.types.SupportsArrayApiBase
      • anndata.types.SupportsArrayApiBase.device
      • anndata.types.SupportsArrayApiBase.dtype
      • anndata.types.SupportsArrayApiBase.ndim
      • anndata.types.SupportsArrayApiBase.shape
      • anndata.types.SupportsArrayApiBase.size
      • anndata.types.SupportsArrayApiBase.__array_namespace__
      • anndata.types.SupportsArrayApiBase.__getitem__
      • anndata.types.SupportsArrayApiBase.to_device
    • anndata.types.SupportsArrayApi
      • anndata.types.SupportsArrayApi.device
      • anndata.types.SupportsArrayApi.dtype
      • anndata.types.SupportsArrayApi.ndim
      • anndata.types.SupportsArrayApi.shape
      • anndata.types.SupportsArrayApi.size
      • anndata.types.SupportsArrayApi.__dlpack__
      • anndata.types.SupportsArrayApi.__dlpack_device__
    • anndata.types.ExtensionNamespace
    • anndata.ImplicitModificationWarning
    • anndata.settings
    • anndata.settings.override
    • anndata.settings.reset
    • anndata.abc.CSRDataset
    • anndata.abc.CSCDataset
    • anndata.typing
  • On-disk format
  • Interoperability
  • Contributing
  • Release notes
  • References
  • API
  • anndata.AnnData
  • anndata.AnnData.var
  • GitHub
  • Discourse
  • scverse.org
  • Core
  • AnnData
  • decoupler
  • MuData
  • Muon
  • Pertpy
  • rapids-singlecell
  • Scanpy
  • Scirpy
  • scvi-tools
  • SnapATAC2
  • SpatialData
  • Squidpy
  • Ecosystem
  • AESTETIK
  • AlphaPeptTools
  • annbatch
  • anndata for R
  • anndataR
  • annsel
  • ATLAS
  • benGRN
  • bento-tools
  • biolord
  • cell2location
  • Cell_BLAST
  • CellAnnotator
  • CellCharter
  • CellMapper
  • CellOracle
  • CellphoneDB
  • CellRank
  • cellxgene
  • Cirrocumulus
  • clone2vec
  • dandelion
  • delnx
  • DOTools_py
  • DoubletDetection
  • DRVI
  • dvp-io
  • dynamo-release
  • epiScanpy
  • eschr
  • fava
  • flashdeconv
  • flowsom
  • GPTBioInsightor
  • grassp
  • GRnnData
  • gssnng
  • hotspot
  • illico
  • infercnvpy
  • kompot
  • LazySlide
  • liana
  • Marsilea
  • maxspin
  • moscot
  • Mowgli
  • Multivelo
  • ncountr
  • NicheNetPy
  • nichepca
  • novae
  • omicverse
  • Palantir
  • Panpipes
  • ParTIpy
  • PathML
  • pcdl
  • PEAKQC
  • pegasus
  • PILOT
  • popV
  • pycea
  • pychromVAR
  • pyCrossTalkeR
  • PyDESeq2
  • pyLemur
  • pySCENIC
  • pytximport
  • pyUCell
  • Rectangle
  • SC2Spa
  • SCALEX
  • scanpro
  • scCellFie
  • scDataLoader
  • scFates
  • scGen
  • schist
  • scib
  • scib-metrics
  • scib-rapids
  • scmcp
  • scPRINT
  • scPRINT-2
  • scTriangulate
  • scVelo
  • scviva-tools
  • scxmatch
  • scXpand
  • scyan
  • sift-sc
  • sincei
  • Sobolev Alignment
  • sopa
  • spatial-eggplant
  • spatialdataR
  • spatialproteomics
  • spatiomic
  • STMiner
  • Symphonypy
  • tangram
  • TAU Community Detection
  • TreeData
  • vitessce
  • wsidata
  • zellkonverter

anndata.AnnData.var#

property AnnData.var: DataFrame | Dataset2D#

One-dimensional annotation of variables/ features (pd.DataFrame).

Setter accepts:

DataFrame | Dataset | Dataset2D

previous

anndata.AnnData.uns

next

anndata.AnnData.var_names

On this page
  • AnnData.var
Edit on GitHub
Show Source
© 2026, scverse scverse is a NumFOCUS affiliated project. Governance · Discourse · Get involved